能缩小身体的蚂蚁男孩这次要对付的不是反派，而是全校师生被植入“乖顺芯片”后的集体无意识。
佩尔已经习惯了以蚂蚁男孩的身份守护学校，但随着升入中学，他发现最大的敌人不是恶霸，而是新校长推行的一套“完美公民养成系统”。所有学生都被要求佩戴智能手环，用来检测“违纪指数”，违纪分过高者会被强制参加“快乐再教育营”。佩尔起初以为这是好事，直到他发现手环会主动屏蔽学生们的愤怒和反抗情绪。更可怕的是，他的好朋友也变成了系统维护员。佩尔必须缩小身体，钻进手环内部服务器，在巨型电路板上展开一场微观世界的终极决战，找回被删除的“不乖基因”。
虽然是儿童片，但对教育规训的讽刺犀利得不像童话。缩小后的视觉设计充满童趣，同时保留了前作特有的北欧冷幽默。结局没有简单砸烂系统，而是让学生们学会“有选择地不乖”，立意更高。
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